Historia miasta, które pierwotnie nazywano Królestwem Nowej Galicji, trwa.
Znajduje się tam również stare kolegium jezuickie Santo Tomás de Aquino, zbudowane w ostatniej dekadzie XVI wieku, które w 1792 roku zostało zajęte przez Uniwersytet. Z konstrukcji pozostało tylko to, co było kościołem, z jego monumentalną kopułą z ubiegłego wieku i dołączoną kaplicą Loreto, zbudowaną w 1695 roku przez Juana María de Salvatierra. Świątynia San Juan de Dios, która dawniej była kaplicą Santa Veracruz, zbudowana w XVI wieku przez Don Pedro Gómeza Maravera, została zbudowana w XVIII wieku z barokową fasadą o stonowanych cechach. Kościół La Merced, w stylu barokowym podobnym do San Juan de Dios, choć bardziej ozdobny, został założony w XVII wieku przez braci Miguela Telmo i Miguela de Albuquerque.
Świątynia La Soledad została zbudowana pod koniec XVII i na początku XVIII wieku na zlecenie Juana Romana de Torres i jej męża, kapitana Juana Bautista Panduro. W tym miejscu znajdowało się bractwo Matki Bożej Samotności i Grobu Świętego, zajmujące kaplicę poświęconą San Francisco Xavier. Świątynia i szkoła San Diego, dzieło XVII wieku; pierwsza z bardzo stonowaną fasadą, która już wydaje się należeć do stylu neoklasycystycznego, a druga z piękną arkadą zdobiącą stary krużganek.
Kościół Jesús María, przyłączony do klasztoru o tej samej nazwie, został założony w 1722 roku; nadal zachowuje barokowe fasady, na których można zobaczyć duże rzeźby przedstawiające Sagrada Familia, Virgen de la Luz, San Francisco i Santo Domingo.
Na koniec należy zwrócić uwagę na trzy inne budowle religijne, które okazały się najlepszymi przykładami, każdy w swoim rodzaju, rozwoju architektury kolonialnej w Guadalajarze, głównie między XVII a XVIII wiekiem. Tak więc mamy kaplicę Aránzazu z połowy XVIII wieku, z ciekawą dzwonnicą i wnętrzem ozdobionym wspaniałymi obrazami i ołtarzami Churrigueresque z tego samego okresu i uważanymi za najlepsze w mieście. Klasztor i kościół Santa Mónica, założony przez księdza Feliciano Pimentela w pierwszej połowie XVIII wieku; jego świątynia posiada podwójną fasadę z bogatą ornamentyką skatalogowaną jako najlepszy przykład bujnego baroku salomońskiego. Świątynia San Felipe Neri, zbudowana w 1766 roku przez architekta Pedro Ciprés, tworzy zestaw niezwykłej trzeźwości, który zawiera elementy ze wspomnieniami Plateresque w swojej ornamentyce, aspekt, który stawia świątynię jako najlepszy budynek religijny w Guadalajarze.
W konstrukcjach odpowiadających architekturze cywilnej znajdują się godne podziwu budynki, wśród których można wymienić Pałac Rządowy, stare domy królewskie, które zostały zmodyfikowane w XVIII wieku według projektu inżyniera wojskowego Juana Francisco Espino, chociaż fasada była dzieło Miguela José Conique. Budynek został pomyślany zasadniczo w stylu barokowym, ale już widać w nim pewne neoklasyczne tendencje. Na jego terenie działały królewskie biura, które znajdowały się w nieistniejącym Palacio de Medrano oraz sale audiencyjne.
Mamy również soborowe seminarium poświęcone San José, zainaugurowane przez biskupa Galindo y Cháveza w 1701 roku, obecnie zajmowane przez Muzeum Regionalne Guadalajary, z głównym krużgankiem z kolumn w stylu toskańskim i barokowymi drzwiami. Słynny Hospicio Cabañas zbudowany na początku XIX wieku według planów wybitnego architekta Manuela Tolsá, kierującego dziełem José Gutiérreza i ukończony po latach przez architekta Gómeza Ibarra, stanowi znamienny przykład stylu neoklasycystycznego.
Wśród innych drobnych konstrukcji, które zapewniły stylistyczną jedność miastu Guadalajara, możemy wymienić, choć nie wszystkie zachowały się: okazałą XVI-wieczną rezydencję, która stała przed dawnym placem San Sebastián w dzielnicy Analco. Dom przy Calle de la Alhóndiga nr 114, obecnie Pino Suárez. Rezydencje należące do rodziny Sánchez Leñero pod numerem 37 i rezydencji pana Dionisio Rodrígueza pod numerem 133 przy Calle de Alcalde. Dom Calderón, tradycyjny kolonialny sklep ze słodyczami założony w 1729 roku i znajdujący się na rogu starych ulic Santa Teresa i Santuario, dziś Morelos i Pedro Loza; Francisco Velarde, w stylu neoklasycystycznym, i wreszcie ten, który był rezydencją Cañedo, znajdującą się z tyłu katedry.
Na obrzeżach Guadalajary, trzeciego co do wielkości miasta w kraju, znajduje się stare miasto San Juan Bautista Melzquititlán, dziś San Juan de los Lagos. To miasto stało się ważnym ośrodkiem religijnym ze względu na wielką cudowną tradycję obrazu Matki Boskiej, która zachowuje swoją bazylikę, zbudowaną w połowie XVII wieku przez Don Juana Rodrígueza Estradę. W tym samym mieście można zobaczyć inne budowle, takie jak Świątynia Trzeciego Zakonu, Kaplica Kalwarii, Kaplica Pierwszego Cudu z XVII i XVIII wieku. Istnieją również ważne budynki cywilne, takie jak między innymi Pałac Kolegium i budynek Dziesięciny.
W mieście Lagos de Moreno można zobaczyć jego główną parafię, XVII-wieczne dzieło z piękną fasadą w stylu Churrigueresque.
Wreszcie w San Pedro Tlaquepaque znajduje się kilka przykładów barokowej architektury sakralnej w regionie, takich jak parafia San Pedro i świątynia Soledad.
