Ponieważ nie wiedzieli, jak daleko rozciąga się północ kraju, jezuici przybyli do Chihuahua. W XVII wieku obecny stan został utworzony w jego południowo-zachodniej części przez tak zwany region Chínipas, podczas gdy reszta terytorium została podzielona między górną i dolną Tarahumarę.
Pierwsze próby ewangelizacji Chihuahua pochodziły z podróży jezuitów osiedlonych wcześniej w stanie Sinaloa. Pierwszą zbudowaną w tym regionie była ta wzniesiona przez ojca Juana Castiniego w 1621 roku i znana jako misja Chínipas.
Jezuici pracowali w górach wśród Indian Tepehuanes, Guazaparas i Tarahumara, podczas gdy franciszkanie pracowali w dolinach i na równinach. Pierwszym stałym misjonarzem w regionie Chínipas był jezuita o. Julio Pascual, który zginął śmiercią męczeńską w 1632 r. Razem z o. Manuelem Martínezem. Do 1680 roku Fray Juan María Salvatierra dał energiczny impuls misji, która została skonsolidowana w latach 1690 i 1730. W połowie XVII wieku misje jezuickie w regionie Chínipas stały się jednymi z najlepiej zorganizowanych i zaawansowanych.
Na południu znajdowała się Nabogame, gdzie nadal można zobaczyć kościół, wikary i dom misyjny, który ojciec Miguel Wiytz zbudował w 1744 roku. Baborigame Satevo znajduje się na tym samym obszarze, który zyskał nowy wigor dzięki administracji księdza Luisa Martína. i Tubares, założona w 1699 roku przez księdza Manuela Ordaza i wskrzeszona przez administrację historyka Félixa Sebastiána. Ten ostatni był uważany za jeden z najbogatszych w kościele, domu, bydle i ranczach. W centrum znajdują się misje Cerocahui, Guazapares, Chínipas, Santa Ana, a na północy Babarocos i Moris.
Obszar Tarahumara Baja został po raz pierwszy zewangelizowany przez ojca Juana Fonte, który dokonał pierwszego wpisu w 1608 r. W 1639 r. Ojciec Jerónimo Figueroa zbudował misję San Pablo Balleza i Huejotitán (San Jerónimo), podczas gdy w tym samym czasie ojciec José Pascual budował San Felipe. W tym samym regionie Tarahumara znajdują się również La joya, Santa María de las Cuevas i San Javier Savetó, ostatnia misja zbudowana w 1640 roku przez ojca Virgilio Máeza.
Jeśli chodzi o terytorium Tarahumara Alta, które obejmowało centrum i północ od tej jednostki, dzieło ewangelizacyjne rozpoczęli księża Tarda, Guadalajara, Celada, Tarkay i Neuman. Misje zawarte w tym regionie to: Tonachi, Norogachi, Nonoava, Narárachi, Sisoguichi, Carichi, San Borja, Temechí lub Temeichi, Coyachi lub Coyachic, Tomochi lub Tomochic, Tutuaca lub Tutuata, Papigochi, Santo Tomás, Matachi i Tesomachi. W połowie XVII wieku misja jezuicka Chihuahua stała się najlepiej zorganizowana i administrowana, z wyjątkiem tych w Kalifornii.
Na terytorium Chihuahuan prowadzona była także praca misyjna franciszkanów. Celem zakonników było uzupełnienie więzi, która istniała już na północy Zacatecas, dla której założyli klasztory w Chihuahua i Durango. Klasztory, podobnie jak jezuici, musiały spełniać cel ewangelizacji niewiernych. Powstały budynki Nuestra Señora del Norte, czyli obecnie Ciudad Juárez, San Buenaventura de Atotonilco (Villa López), Santiago Babonoyaba, Parral, Santa Isabel de Tarahumara, San Pedro de los Conchos, Bachiniva lub Bacínava (Nuestra Señora de Natividad ), Namiquipa (San Pedro Alcántara), Carretas (Santa María de Gracia), Julimes, San Andrés, Nombre de Dios, San Felipe el Real de Chihuahua i Casas Grandes.
